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GSEA 不是黑盒!手写实现全算法(排序→加权游走→ES→置换→NES)!R语言(附代码+数据)
📋总体概括
手写实现 GSEA:全基因按 log2FC 排序→加权游走算 ES→替换 200 次算 NES 与 p→画出条形码+富集分数经典图。讲透 GSEA 与 ORA 的分工(阈值列表 vs 全排序、"偏多" vs "偏置")、为什么置换、三个常见坑。零包依赖、原理全开。附代码+模拟数据。
⚡关键信息
- ▸手写实现 GSEA:全基因按 log2FC 排序→加权游走算 ES→替换 200 次算 NES 与 p→画出条形码+富集
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